Obwohl nur wenige Informationen über den Bestand der einzelnen Populationen verfügbar sind, kann davon ausgegangen werden, dass die Habitate aller Arten unter starkem Druck stehen. Sie werden vor allem durch die Abholzung und Brandrodung der tropischen Wälder und die Umwandlung zu landwirtschaftlichen Nutzflächen stetig verkleinert. Das übermäßige Sammeln der Pflanzen für den Export zur Befriedigung der Nachfrage aus allen Teilen der Welt verstärkt dieses Problem noch zusätzlich. Von einigen Arten sind nur die Funde der jeweiligen Erstbeschreibung bekannt, so dass die Annahme, dass endemische Arten möglicherweise bereits wieder ausgelöscht wurden, bevor sie überhaupt in Kultur gelangten, nicht ganz von der Hand zu weisen ist.

Zum Schutz der Pflanzen wurden Regularien erlassen, die den Handel und den Umgang mit ihnen reglementieren. Alle Phalaenopsis-Arten stehen im Anhang II des Washingtoner Artenschutz-Übereinkommens (WA). Ihre Einfuhr ist somit nur mit gültigen CITES-Papieren (sowohl vom Export- als auch vom Importland) sowie dem obligatorischen Gesundheitszeugnis möglich. Die Auslegung und Umsetzung der Cites-Vorschriften kann man als durchaus umstritten ansehen, denn das eigentliche Hauptproblem ist nicht der Handel mit den Pflanzen, sondern die Zerstörung des Lebensraumes vor Ort.

Phalaenopsis-Orchideen sind als tropische Gewächse sehr wärmebedürftig und werden in Deutschland unter hohem Energieeinsatz in beheizten Gewächshäusern kultiviert. Manche der sensiblen Orchideen brauchen konstant 27°C Wärme während der ersten Zweidrittel des Wachstums und für das letzte Drittel bis zur Blüte müssen es immerhin noch 18°C sein. Daher muss die Unterglasfläche fast das ganze Jahr über beheizt werden, selbst in den meisten Sommernächten. Ein sehr energieintensives und kostspieliges Unterfangen. Mehrere auf Orchideen spezialisierte Gartenbaubetriebe verfügen auf ihren Gelände über ein Blockheizkraftwerk (BHKW), die mit importiertem billigen Palmöl betrieben werden . Für die Palmölproduktion auf großen agroindustriellen Plantagen vor allem in Südostasien - Haupterzeugerländer sind Indonesien und Malaysia - werden die dortigen Regenwälder gerodet. Die Auswirkungen für Umwelt, Artenvielfalt, Indigene und Kleinbauern sowie das Weltklima sind gravierend. Die Verbrennung von Palmöl in den BHKWs wird über das Erneuerbare-Energien-Gesetz (EEG) mit bis zu 19,4 Cent/kWh finanziell gefördert.

Die folgende Artenliste, gegliedert nach Untergattungen und Sektionen, orientiert sich an der Monografie von E. A. Christenson aus dem Jahr 2001.

• Untergattung Proboscidiodes (Rolfe) E.A.Christ.
  • Phalaenopsis lowii

• Untergattung Aphyllae (Sweet) E.A.Christ. (einige Arten dieser Untergattung bildeten ursprünglich die Gattung Kingidium; diese Arten sind mit * gekennzeichnet)
  • Phalaenopsis taenialis*
  • Phalaenopsis braceana*
  • Phalaenopsis minus*
  • Phalaenopsis wilsonii
  • Phalaenopsis stobartiana
  • Phalaenopsis hainanensis
  • Phalaenopsis honghenensis

• Untergattung Parishianae (Sweet) E.A.Christ.
  • Phalaenopsis appendiculata
  • Phalaenopsis gibbosa
  • Phalaenopsis lobbii
  • Phalaenopsis parishii

• Untergattung Polychilos (Breda) E.A.Christ.
  • Sektion Polychilos (Breda) Rchb.f.
    • Phalaenopsis mannii
    • Phalaenopsis cornu-cervi
    • Phalaenopsis borneënsis
    • Phalaenopsis pantherina
  • Sektion Fuscatae Sweet
    • Phalaenopsis cochlearis
    • Phalaenopsis viridis
    • Phalaenopsis fuscata
    • Phalaenopsis kunstleri
  • Sektion Amboinenses Sweet
    • Phalaenopsis pulchra
    • Phalaenopsis violacea
    • Phalaenopsis bellina
    • Phalaenopsis micholitzii
    • Phalaenopsis fimbriata
    • Phalaenopsis floresensis
    • Phalaenopsis robinsonii
    • Phalaenopsis gigantea
    • Phalaenopsis fasciata
    • Phalaenopsis doweryënsis
    • Phalaenopsis luteola
    • Phalaenopsis modesta
    • Phalaenopsis maculata
    • Phalaenopsis javanica
    • Phalaenopsis mariae
    • Phalaenopsis amboinensis
    • Phalaenopsis lueddemanniana
    • Phalaenopsis venosa
    • Phalaenopsis reichenbachiana
    • Phalaenopsis pallens
    • Phalaenopsis bastianii
    • Phalaenopsis hieroglyphica
  • Sektion Zebrina Pfitz.
    • Phalaenopsis inscriptiosinensis
    • Phalaenopsis speciosa
    • Phalaenopsis tetraspis
    • Phalaenopsis corningiana
    • Phalaenopsis sumatrana

• Untergattung Phalaenopsis
  • Sektion Phalaenopsis
    • Phalaenopsis philippinensis
    • Phalaenopsis stuartiana
    • Phalaenopsis amabilis
    • Phalaenopsis aphrodite
    • Phalaenopsis sanderiana
    • Phalaenopsis schilleriana
  • Sektion Deliciosae E.A.Christ.
    • Phalaenopsis chibae
    • Phalaenopsis deliciosa (diese Art gehörte ehemals zur Gattung Kingidium)
    • Phalaenopsis mysorensis
  • Sektion Esmeralda Rchb.f. (diese Sektion entstand aus der ehemals monotypischen Gattung Doritis)
    • Phalaenopsis buyssoniana
    • Phalaenopsis pulcherrima
    • Phalaenopsis regnieriana
  • Sektion Stauroglottis (Schauer) Benth.
    • Phalaenopsis equestris
    • Phalaenopsis celebensis
    • Phalaenopsis lindenii